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独家:采访墨西哥顶尖猪流感实验室负责人

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微生物学家西莉亚Alpuche负责实验室在墨西哥,已成为该国爆发猪流感的地面零。 Alpuche昨日在她墨西哥城诊断和医疗流行病学研究所(InDRE)的办公室与 Science 交谈。

许多人提出了关于墨西哥是否早些时候能够检测到这种爆发并在其传播到其他地方之前将其包含在内的问题。但正如Alpuche所解释的,InDRE有一个令人困惑的情况,因为这种病毒在流感季节中间出现 - 而且它可能不是在墨西哥发源的。 Alpuche也直言不讳,为什么花了几个星期的时间才将爆发与第一例症状联系起来,这是一名来自韦拉克鲁斯州La Gloria的4岁男孩。她坦率地描述了自己实验室的局限性。

InDRE与加拿大公共卫生署和美国疾病控制和预防中心(CDC)密切合作,将病毒确定为爆发的原因,墨西哥继续合作测试疑似病例样本。截至5月1日,墨西哥有156例确诊病例和9例死亡病例,比世界上任何国家都多。根据美国疾病控制和预防中心“发病率和死亡率周报” MMWR )昨天的报道,墨西哥已经确定了另外1918例疑似病例,而InDRE正在着手梳理有多少人实际上是猪流感。

流感病毒是由两种菌株A和B以及几种不同的亚型引起的,这两种亚型是由两种蛋白质钉住病毒表面,血凝素和神经氨酸酶,然后是一些数字。爆发是由甲型H1N1流感病毒引起的。

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科学 :有很多关于起源和时间的问题。何时有迹象表明呼吸道病例数量异常?

Alpuche :4月7日,我们听说国立呼吸系统疾病研究所在以前是健康的年轻人中患有异常严重的肺炎病例。立即,我们开始获取围绕这个集群的数据。我们也开始对我们的流感数据进行回顾性分析。

我们查看了自1月份以来本月至今的所有关于流感检测的数据,并与过去的流感季节进行了比较。除了不寻常的肺炎之外,我们开始有传言说还有其他并非肺炎的病例,就像呼吸道疾病,流感样疾病。

科学 :您是否从您的流感趋势分析中看到任何东西告诉了您什么?

Alpuche :它首先告诉我们的是,我们仍然在该国检测流感,而不仅仅是在墨西哥城。这与我们每年看到的差不多,除了它是流感季节的延长。然后我们分析了流感毒株的亚型,我们看到的一个不寻常的事情是,在这个季节,我们在11月和12月的最后一个高峰期和二月份的另一个高峰期。在本赛季,我们的乙型流感病毒数量比前一年增加了一倍。

科学 :这与本次疫情无关。

Alpuche :与此无关。这很混乱。我们发现37%的病例是B,而我们只有15%的病例是B。然后我们查看了他们在CDC的流感监测系统中的数据,看是否有异常。我们在美国也看到了类似的情况 - 长时间的流感和增加的B型流感。所以我们认为我们有与流感有关的东西,并且我们仍然担心肺炎病例。我们立即回过头来看看自从季节开始以来,我们在该国发生的所有流感爆发,看看这是否与长期流感有关,还是有其他我们所看到的。我们在墨西哥中部的一些州特拉斯卡拉爆发了小规模疫情,然后我们最后一次爆发在韦拉克鲁斯州,在佩罗特附近的La Gloria镇。那是在三月的最后两周。

科学 :为什么在3月的最后2周没有引起关注?

Alpuche :这是流感样疾病,没有死亡和没有肺炎的情况。国家流行病学家对此爆发进行了深入研究。韦拉克鲁斯卫生部长在3月份的最后2周爆发期间做得非常出色。

科学 :他们有什么能力来输入亚型?

Alpuche :墨西哥的流感以实验室为基础的监测网络正在使用免疫荧光 - 这是筛查测试,它使用针对A和B的抗体。所以这就是公共健康状态实验室正在做的事情。

科学 :所以他们没有亚型测试,不得不将样品提交给你?

Alpuche :是的。不是马上,因为如果没有什么不寻常的,他们会等待积累的案件,然后发送到国家转诊中心。这次爆发的一个有趣的事情是他们正在测试,但症状的发作是在4或5天后。 72小时后免疫荧光试验的灵敏度很低。大多数测试,这是鼻咽拭子,是负面的。

Scienc e:你后来从La Gloria做了更多的采样,对吧?

Alpuche :在La Gloria疫情的最后一部分,儿童于4月1日开始出现症状。他们于4月3日接受了样本。他们将样本送至公共卫生状态实验室,并于4月4日处理。 4月8日抵达我的实验室。

科学 :什么是积极的?

Alpuche :他们只在这段时间结束时确定了三种流感毒株。其中一个是H3N2。另一个是A,但并不令人振奋。在我们的实验室,我们正在考虑它可能是H1,但它看起来不确定。说实话,我们无法输入它。然后我们有一个B.

科学 :你无法打字的那个,你是否发送过其他任何地方?你担心你无法打字吗?

Alpuch e:那时,我们没有任何关于他们在加利福尼亚儿童中看到的无法类型的A的信息。

科学 :在加利福尼亚州的监控计划中,如果您无法输入,请将其发送给CDC。

Alpuche :这就是我们所做的。我们的协作中心是CDC。我们有三个不同的截止日期来完成样品在本赛季发送给CDC的积累。当我们从La Gloria那里得到第一个不确定的压力时,我们并不担心。那时,疫情得到了控制。

科学 :4月12日,根据国际卫生条例,墨西哥向泛美卫生组织通报了韦拉克鲁斯州流感样疫情。最初,你认为这些病例看起来像流感吗?

Alpuche :正如我们根据“国际卫生条例”报告的那样,我们最初的想法是,我们正在加紧和延长流感期。我们认为特拉斯卡拉和佩罗特的爆发在肺炎方面并不罕见。那些在后面,然后我们开始考虑有一些不寻常的事情。

科学 :4月17日,墨西哥开始增加对流感的监测。是什么促使交换机增强,主动监视?

Alpuche :我们收到了一起孤立病例的通报,一名37岁的女性糖尿病患者因呼吸道疾病和瓦哈卡的肺炎死亡。该女子4月4日出现症状。与佩罗特没有任何关系。我们得到了样本,这是肺活检,因为亲属不允许进行尸体解剖。他们深入调查了这些死亡人员的接触情况。他们发现一些呼吸道疾病,但没有死亡。没什么不寻常的,好吗?他们经过测试,都是消极的 用于流感和其他病毒。

科学 :您是什么时候首次联系加拿大公共卫生机构国家微生物实验室主任Frank Plummer的?

Alpuche :我于4月17日通过电子邮件联系了他,他立即回答。他想更多地了解这一点,并且我们在4月18日星期六进行了长时间的交谈。

科学 :弗兰克告诉我他最初并不认为流感。他认为这将是一个未知的病原体。

Alpuche :的确如此。我们与Plummer博士进行了讨论。事实上,我是那个打电话给他的人,因为我是实验室人员。我通过全球卫生安全行动小组与他会面。我们一直在谈论不同的合作,当我们开始讨论这个和流行病学时,我们想要排除一切可能。

科学 :你为什么联系他?

Alpuche :加拿大在SARS严重急性呼吸综合征(SARS)筛查方面有很多经验,这些SARS病因不明。

科学 :您是什么时候知道4月21日 MMWR 报告的前两次加利福尼亚猪流感病例的。

Alpuche :CDC寄给我一份预印本。我不确定何时。

科学 :样品何时送到加拿大和CDC?

Alpuche :4月21日。我们同时向两个人寻求帮助。 CDC是我在世卫组织网络中的合作中心。他们一直在帮助我们,为我们进行质量评估,为我们提供试剂,进行培训和转让技术。但是要为他们两人做运输,这很难。获得美国所有许可之后有一点延迟

科学 :您是否决定将其发送到加拿大还因为美国当局拿着您的样品?

Alpuche :不,完全没有。我将这些样本发送给CDC,因为他们是我的合作中心。这是做到这一点的方法。我们从CDC获得所需的全部帮助。

科学 :但我认为这对美国很重要。您的样品搁置了多久?为什么?

Alpuche :这仅仅是1天的差距。我不能告诉你这是因为从墨西哥送到美国而不是加拿大更难。说实话,我无法解释这一点。

科学 :我想你会因为延迟而感到沮丧。

Alpuche :是的,但我们知道我们将得到我们需要的帮助,而且我们已经得到了它。这只是一个小小的差异。

科学 :你什么时候第一次听到Frank Plummer关于你的样品的回音?

Alpuche :我们在4月22日获得了初步结果.Pulummer博士在下午3点得到样品,午夜他打电话给我说我们患了A型流感。我寄给他的一些样品,我们知道他们是甲型流感。那个星期,我们开始看到甲型流感病毒,我们开始改变我们关于这种乙型流感延长季节性流感的想法。

科学 :你什么时候知道他们对一种新的猪流感病毒是阳性的?

Alpuche :我第一次知道它是来自Frank Plummer的猪,那是在4月23日下午。然后那天晚上,CDC的Nancy Cox博士在我们与墨西哥专家的电话会议上讨论了这个问题,她给了我们初步结果,我们有一些猪的菌株,那天刚刚到达CDC。

科学 :您如何看待墨西哥早前做得不够的批评?它来自墨西哥媒体和国际媒体。

Alpuche :总有一些事情可以找到有罪的人 一切。这是一种新的未知病毒。最近,我们在诊断和流行病学监测方面的发展非常迅速。我们仍然有局限,这是肯定的。我们确实需要接受这一点。我们正在努力克服这些限制。我们和所有卫生部门一起,尽一切可能试图尽快确定这一点。

我们正​​在努力尝试和控制这一点。我们从一开始就非常开放。当我收到Frank Plummer博士的确认函时,我立即与我的上级MauricioHernández博士取得联系,他立即与科尔多瓦秘书谈话,他基本上是开放的。

科学 :我前往墨西哥城的许多实验室都非常复杂。有哪些限制阻碍了您的实验室识别新的H1N1病毒? CDC和加拿大有什么你没有的?

Alpuche :在墨西哥做亚型的唯一地方就是这里的实验室。我们能够测序和亚型,但我们对来自全国各地的流感样本和其他东西感到不知所措。这比美国或加拿大慢一点。

科学 :但实验室中隔离病毒并对其进行排序的限制是什么?

Alpuche :本周以来,我们有来自CDC和加拿大的专家帮助我们建立实时PCR [聚合酶链反应]技术,以直接测试猪H1N1病毒。

科学 :您的实验室是否是该国唯一可以使用实时PCR仪进行确认测试的实验室?

Alpuche :在这一点上,是的,但我们正在与CDC和加拿大一起在墨西哥六个不同州的不同机构培训分子生物学家。我们有两台即时获得的实时PCR仪 - 我们从公司借了一台。现在我们又购买了10台机器。我们正在全职工作以加速诊断。

科学 :您有多少样品需要测试?

Alpuche :现在,我们有大约1000个测试需要积压,我们正在赶时间做。我们有三班人在上午,下午和过夜工作。

科学 :您有1000个样本正在等待测试,但有近2000个疑似病例。

Alpuche :并非所有在医院进行过测试的病例都有转介给我们的样本。并不是所有的1000个样本都是可疑病例。

科学 :您还在向CDC和加拿大发送样本吗?

Alpuche :是的,我们本周向加拿大发送了更多样本,我们正在与CDC的人员安排向CDC发送更多样本。我们想排除我们所有的这些样本,以便我们可以继续使用新的样本。

科学 :很多墨西哥媒体和墨西哥以外的媒体都在关于La Gloria和附近佩罗特Granjas Carroll的大型养猪场写过文章。有所有这些指控甚至阴谋论。

Alpuche :我不知道,有这么多的谣言。

科学 :那么受到如此多关注的La Gloria男孩呢?

Alpuche :这是轻微的疾病,没问题。

科学 :他是否是索引案例准确?

Alpuche :我们不确定。症状出现后,他是我们在数据库中看到的第一个,就是这样。

科学 :什么是他的发病。

Alpuche :April 1.

科学 :已经有Perote作为震中或发起者的所有这些故事。你相信吗?

Alpuche :我们已经 一直在问农业部门,他们向我们保证,他们没有发现佩罗特附近这些农场的动物爆发问题。农场距拉格洛里亚80公里。

科学 :所以它很远。

Alpuche :即使在那里工作的人通勤。但我们正在调查这一点。我们正在进行流行病学监测。我们问其他当局,基本上没有错。

科学 :Granjas Carroll的任何员工是否有确诊病例?

Alpuche :到目前为止我并不知道。

科学 :其中一个理论是,这起源于美国或其他地方,一个人来到墨西哥,可能是一个移民。这是一个大猪场的假设可能是非常具有误导性的。

Alpuche :可以。这是我们的想法。我们需要更多数据来证明这一点。其中一件有趣的事情是,我们看到这些案件在瓦哈卡和佩罗特分离,他们以移民而闻名。另一个州,我们现在看到几例现在在流行的疫情是圣路易斯波托西,它就像迁徙的走廊。很难相信它会与这个农场有关,但我知道当局已经彻底调查过它。

科学 :你认为如果这种情况在墨西哥以外的某个地方出现,它会被遏制吗?或者流感是否移动得太快?

Alpuche :考虑到这是赛季结束,也许这会让事实混淆一点,那就是别的东西可能会增长,但无论如何,流感的流行可能会很快。

科学 :美国很早就发现了病例,而美国无法控制病例。它告诉我病毒更聪明。

Alpuche :是的,这是肯定的。

科学 :最后一件事。你睡了多少个小时。

Alpuche :[笑声]最多两个。

科学 :这已经持续2周了。

Alpuche :是的,所以有些日子我们需要2个小时,然后半小时的午睡。还有Latte。双枪。浓咖啡。

科学 :任何你需要的东西,现在来自国际社会的任何东西?

Alpuche :我们现在正以我们工作的方式和我们的合作者。但在某些时候,如果我们确实需要它,我会问。但现在,我们没事。

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